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按手術方式劃分：
開放吻合器：主要用于傳統的開腹手術，如腹部外科、胸外科和小兒外科手術等。
腔鏡吻合器：用于微創手術，如腹腔鏡膽囊切除、結直腸癌切除等。
按結構和功能劃分：
線性吻合器：用于組織的線性縫合，常用于腹部外科和胸外科。
環形吻合器（圓形吻合器） ：用于肛腸手術和消化道重建。
線性切割吻合器：同時具有切割和縫合功能，適用于需要快速離斷和閉合的手術。
荷包吻合器：用于制作荷包縫合，常用于肛腸手術。
皮膚吻合器：用于皮膚和筋膜的縫合。
管型吻合器：用于消化道重建手術中的端端、端側和側側吻合。
按使用場景劃分：
腔鏡專用吻合器：主要用于微創手術，如心胸外科、胃腸外科等。
開放吻合器：適用于傳統開腹手術。
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