醫用標記筆的原理是利用特殊的墨水及其化學組成，可以在人體皮膚、黏膜和手術用品表面等不易脫落或污染的部位上，持久地留下標記，如手術部位標記、注射部位標記等。而這種墨水通常是無毒、不含重金屬、易于消除，并且可以在高溫、高壓下不失效。
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